舰队中只能任命一艘。任命为旗舰后舰船的防御、攻击、了望、耐久、航等属性都将得到提升。在海战中舰旗不沉意味着整个舰队随时随地都可以相互联系。旗舰一旦被击沉舰队间的联系立即中断并且士气将受到极大打击。
下面是各种战斗舰船旗舰的任命标准：
1、箭船：无法任命旗舰。
战舰：过二百艘可以任命一艘旗舰。
大型战舰：过一百二十艘可以任命一艘旗舰。
4炮舰：过五十艘可以任命一艘旗舰。
5铁甲炮舰：过三十艘可以任命一艘旗舰。
6精锐铁甲炮舰：过十二艘可以任命一艘旗舰。另：旗舰所率领的船只越多能力加持越高。
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